Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copz1P61924 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copz1P61924 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Copz1P61924 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copz1P61924 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copz1P61924 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copz1P61924 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copz1P61924 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Copz1P61924 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms