Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Depdc5P61460 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Depdc5P61460 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Depdc5P61460 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Depdc5P61460 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Depdc5P61460 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Depdc5P61460 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Depdc5P61460 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Depdc5P61460 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms