Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stx1bP61264 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stx1bP61264 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms