Protein–RNA interactions for Protein: P61089

Ube2n, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2nP61089 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2nP61089 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2nP61089 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2nP61089 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2nP61089 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2nP61089 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2nP61089 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2nP61089 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2nP61089 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2nP61089 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2nP61089 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2nP61089 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2nP61089 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2nP61089 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2nP61089 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2nP61089 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2nP61089 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2nP61089 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms