Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ActbP60710 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ActbP60710 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ActbP60710 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ActbP60710 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ActbP60710 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ActbP60710 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ActbP60710 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ActbP60710 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ActbP60710 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ActbP60710 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ActbP60710 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ActbP60710 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ActbP60710 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ActbP60710 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ActbP60710 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ActbP60710 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ActbP60710 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ActbP60710 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ActbP60710 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ActbP60710 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ActbP60710 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ActbP60710 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ActbP60710 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ActbP60710 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ActbP60710 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ActbP60710 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ActbP60710 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ActbP60710 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ActbP60710 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ActbP60710 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ActbP60710 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ActbP60710 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ActbP60710 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ActbP60710 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ActbP60710 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ActbP60710 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ActbP60710 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ActbP60710 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ActbP60710 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ActbP60710 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ActbP60710 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ActbP60710 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ActbP60710 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ActbP60710 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ActbP60710 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ActbP60710 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ActbP60710 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ActbP60710 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ActbP60710 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ActbP60710 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ActbP60710 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ActbP60710 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ActbP60710 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ActbP60710 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ActbP60710 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ActbP60710 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ActbP60710 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ActbP60710 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ActbP60710 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ActbP60710 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ActbP60710 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ActbP60710 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ActbP60710 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ActbP60710 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ActbP60710 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ActbP60710 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ActbP60710 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ActbP60710 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ActbP60710 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ActbP60710 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ActbP60710 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ActbP60710 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ActbP60710 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ActbP60710 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ActbP60710 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ActbP60710 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ActbP60710 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ActbP60710 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ActbP60710 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ActbP60710 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ActbP60710 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ActbP60710 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ActbP60710 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ActbP60710 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ActbP60710 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ActbP60710 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ActbP60710 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ActbP60710 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ActbP60710 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ActbP60710 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ActbP60710 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ActbP60710 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ActbP60710 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ActbP60710 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ActbP60710 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ActbP60710 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ActbP60710 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ActbP60710 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ActbP60710 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms