Protein–RNA interactions for Protein: P59110

Senp1, Sentrin-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp1P59110 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Senp1P59110 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Senp1P59110 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Senp1P59110 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Senp1P59110 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Senp1P59110 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Senp1P59110 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Senp1P59110 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Senp1P59110 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Senp1P59110 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Senp1P59110 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Senp1P59110 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Senp1P59110 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Senp1P59110 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Senp1P59110 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Senp1P59110 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Senp1P59110 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Senp1P59110 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Senp1P59110 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Senp1P59110 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Senp1P59110 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Senp1P59110 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Senp1P59110 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Senp1P59110 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Senp1P59110 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Senp1P59110 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Senp1P59110 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Senp1P59110 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Senp1P59110 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Senp1P59110 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Senp1P59110 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Senp1P59110 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Senp1P59110 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Senp1P59110 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Senp1P59110 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Senp1P59110 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Senp1P59110 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Senp1P59110 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Senp1P59110 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Senp1P59110 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Senp1P59110 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Senp1P59110 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Senp1P59110 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Senp1P59110 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Senp1P59110 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms