Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Strn4P58404 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Strn4P58404 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Strn4P58404 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Strn4P58404 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Strn4P58404 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Strn4P58404 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Strn4P58404 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Strn4P58404 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms