Protein–RNA interactions for Protein: P57791

Rce1, CAAX prenyl protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rce1P57791 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rce1P57791 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rce1P57791 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rce1P57791 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rce1P57791 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rce1P57791 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rce1P57791 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rce1P57791 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rce1P57791 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rce1P57791 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rce1P57791 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rce1P57791 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rce1P57791 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rce1P57791 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rce1P57791 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rce1P57791 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rce1P57791 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rce1P57791 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rce1P57791 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rce1P57791 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rce1P57791 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rce1P57791 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rce1P57791 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms