Protein–RNA interactions for Protein: P57722

Pcbp3, Poly(rC)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp3P57722 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcbp3P57722 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pcbp3P57722 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pcbp3P57722 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pcbp3P57722 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pcbp3P57722 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pcbp3P57722 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pcbp3P57722 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcbp3P57722 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcbp3P57722 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcbp3P57722 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcbp3P57722 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcbp3P57722 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcbp3P57722 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcbp3P57722 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcbp3P57722 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcbp3P57722 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms