Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms