Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn18P56857 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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