Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctbp2P56546 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms