Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CckbrP56481 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CckbrP56481 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CckbrP56481 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CckbrP56481 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CckbrP56481 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CckbrP56481 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CckbrP56481 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CckbrP56481 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CckbrP56481 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CckbrP56481 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CckbrP56481 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CckbrP56481 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CckbrP56481 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CckbrP56481 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CckbrP56481 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CckbrP56481 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CckbrP56481 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CckbrP56481 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CckbrP56481 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CckbrP56481 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CckbrP56481 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CckbrP56481 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CckbrP56481 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CckbrP56481 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.8 ms