Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Abcd3P55096 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms