Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GemP55041 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GemP55041 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GemP55041 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GemP55041 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GemP55041 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GemP55041 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GemP55041 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GemP55041 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GemP55041 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GemP55041 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GemP55041 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GemP55041 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GemP55041 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GemP55041 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GemP55041 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GemP55041 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GemP55041 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GemP55041 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GemP55041 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GemP55041 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GemP55041 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GemP55041 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GemP55041 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GemP55041 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GemP55041 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GemP55041 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GemP55041 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GemP55041 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GemP55041 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GemP55041 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GemP55041 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GemP55041 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GemP55041 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GemP55041 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GemP55041 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GemP55041 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GemP55041 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GemP55041 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GemP55041 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GemP55041 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GemP55041 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GemP55041 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GemP55041 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GemP55041 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GemP55041 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GemP55041 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GemP55041 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GemP55041 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GemP55041 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GemP55041 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GemP55041 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GemP55041 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GemP55041 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GemP55041 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GemP55041 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GemP55041 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GemP55041 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GemP55041 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GemP55041 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GemP55041 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GemP55041 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GemP55041 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GemP55041 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GemP55041 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GemP55041 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GemP55041 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GemP55041 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GemP55041 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GemP55041 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GemP55041 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GemP55041 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GemP55041 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GemP55041 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GemP55041 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GemP55041 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GemP55041 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GemP55041 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GemP55041 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GemP55041 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GemP55041 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GemP55041 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GemP55041 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GemP55041 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GemP55041 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GemP55041 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GemP55041 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GemP55041 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GemP55041 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GemP55041 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GemP55041 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GemP55041 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GemP55041 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GemP55041 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GemP55041 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GemP55041 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GemP55041 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GemP55041 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GemP55041 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GemP55041 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms