Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms