Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn1swP51491 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn1swP51491 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms