Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RorcP51450 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RorcP51450 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RorcP51450 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RorcP51450 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RorcP51450 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RorcP51450 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RorcP51450 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RorcP51450 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RorcP51450 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RorcP51450 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RorcP51450 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RorcP51450 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RorcP51450 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RorcP51450 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RorcP51450 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RorcP51450 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RorcP51450 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RorcP51450 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RorcP51450 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RorcP51450 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RorcP51450 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RorcP51450 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RorcP51450 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RorcP51450 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RorcP51450 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RorcP51450 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RorcP51450 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RorcP51450 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RorcP51450 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RorcP51450 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RorcP51450 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RorcP51450 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RorcP51450 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RorcP51450 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RorcP51450 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RorcP51450 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RorcP51450 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RorcP51450 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RorcP51450 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RorcP51450 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RorcP51450 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RorcP51450 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RorcP51450 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RorcP51450 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RorcP51450 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RorcP51450 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RorcP51450 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RorcP51450 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RorcP51450 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RorcP51450 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RorcP51450 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RorcP51450 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RorcP51450 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RorcP51450 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RorcP51450 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RorcP51450 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RorcP51450 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RorcP51450 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RorcP51450 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RorcP51450 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RorcP51450 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RorcP51450 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RorcP51450 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RorcP51450 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RorcP51450 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RorcP51450 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RorcP51450 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RorcP51450 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RorcP51450 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RorcP51450 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RorcP51450 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RorcP51450 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RorcP51450 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RorcP51450 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RorcP51450 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RorcP51450 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RorcP51450 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RorcP51450 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RorcP51450 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RorcP51450 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RorcP51450 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RorcP51450 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RorcP51450 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RorcP51450 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RorcP51450 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RorcP51450 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RorcP51450 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RorcP51450 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RorcP51450 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RorcP51450 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RorcP51450 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RorcP51450 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RorcP51450 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RorcP51450 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RorcP51450 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RorcP51450 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RorcP51450 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RorcP51450 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RorcP51450 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms