Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RoraP51448 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RoraP51448 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RoraP51448 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RoraP51448 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RoraP51448 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RoraP51448 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RoraP51448 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RoraP51448 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RoraP51448 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RoraP51448 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RoraP51448 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RoraP51448 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RoraP51448 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RoraP51448 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RoraP51448 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RoraP51448 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RoraP51448 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RoraP51448 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RoraP51448 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RoraP51448 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RoraP51448 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RoraP51448 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RoraP51448 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RoraP51448 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RoraP51448 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RoraP51448 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RoraP51448 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RoraP51448 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RoraP51448 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RoraP51448 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RoraP51448 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RoraP51448 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RoraP51448 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RoraP51448 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RoraP51448 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RoraP51448 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RoraP51448 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RoraP51448 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
RoraP51448 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
RoraP51448 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RoraP51448 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RoraP51448 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RoraP51448 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RoraP51448 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RoraP51448 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RoraP51448 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RoraP51448 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RoraP51448 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RoraP51448 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RoraP51448 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RoraP51448 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RoraP51448 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RoraP51448 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RoraP51448 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RoraP51448 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RoraP51448 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RoraP51448 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RoraP51448 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RoraP51448 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RoraP51448 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RoraP51448 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RoraP51448 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RoraP51448 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RoraP51448 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RoraP51448 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RoraP51448 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RoraP51448 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RoraP51448 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RoraP51448 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RoraP51448 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RoraP51448 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RoraP51448 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RoraP51448 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RoraP51448 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RoraP51448 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RoraP51448 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RoraP51448 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RoraP51448 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RoraP51448 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RoraP51448 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RoraP51448 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RoraP51448 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RoraP51448 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RoraP51448 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RoraP51448 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RoraP51448 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RoraP51448 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RoraP51448 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RoraP51448 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RoraP51448 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RoraP51448 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RoraP51448 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RoraP51448 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RoraP51448 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RoraP51448 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RoraP51448 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RoraP51448 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RoraP51448 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RoraP51448 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms