Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TspoP50637 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TspoP50637 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TspoP50637 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TspoP50637 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TspoP50637 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TspoP50637 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TspoP50637 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TspoP50637 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TspoP50637 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TspoP50637 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TspoP50637 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TspoP50637 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TspoP50637 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TspoP50637 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TspoP50637 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TspoP50637 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TspoP50637 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TspoP50637 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TspoP50637 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TspoP50637 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TspoP50637 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TspoP50637 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TspoP50637 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TspoP50637 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TspoP50637 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TspoP50637 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TspoP50637 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TspoP50637 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TspoP50637 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TspoP50637 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TspoP50637 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TspoP50637 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TspoP50637 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TspoP50637 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TspoP50637 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TspoP50637 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TspoP50637 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TspoP50637 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TspoP50637 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TspoP50637 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TspoP50637 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TspoP50637 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TspoP50637 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TspoP50637 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TspoP50637 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TspoP50637 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TspoP50637 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TspoP50637 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TspoP50637 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TspoP50637 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TspoP50637 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TspoP50637 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TspoP50637 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TspoP50637 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TspoP50637 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TspoP50637 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TspoP50637 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TspoP50637 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TspoP50637 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TspoP50637 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TspoP50637 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TspoP50637 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TspoP50637 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TspoP50637 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TspoP50637 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TspoP50637 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TspoP50637 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TspoP50637 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TspoP50637 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TspoP50637 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TspoP50637 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TspoP50637 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TspoP50637 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TspoP50637 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TspoP50637 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TspoP50637 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TspoP50637 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TspoP50637 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TspoP50637 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TspoP50637 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TspoP50637 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TspoP50637 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TspoP50637 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TspoP50637 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TspoP50637 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TspoP50637 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TspoP50637 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TspoP50637 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TspoP50637 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TspoP50637 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TspoP50637 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TspoP50637 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TspoP50637 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TspoP50637 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TspoP50637 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TspoP50637 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TspoP50637 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TspoP50637 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TspoP50637 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms