Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FmodP50608 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FmodP50608 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FmodP50608 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FmodP50608 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FmodP50608 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FmodP50608 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FmodP50608 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FmodP50608 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FmodP50608 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FmodP50608 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FmodP50608 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FmodP50608 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FmodP50608 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FmodP50608 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FmodP50608 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FmodP50608 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FmodP50608 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FmodP50608 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FmodP50608 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FmodP50608 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FmodP50608 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FmodP50608 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FmodP50608 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FmodP50608 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FmodP50608 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FmodP50608 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FmodP50608 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FmodP50608 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FmodP50608 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FmodP50608 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FmodP50608 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FmodP50608 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FmodP50608 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FmodP50608 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FmodP50608 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FmodP50608 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FmodP50608 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FmodP50608 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FmodP50608 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FmodP50608 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FmodP50608 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FmodP50608 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FmodP50608 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FmodP50608 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FmodP50608 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FmodP50608 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FmodP50608 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FmodP50608 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FmodP50608 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FmodP50608 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FmodP50608 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FmodP50608 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FmodP50608 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FmodP50608 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FmodP50608 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FmodP50608 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FmodP50608 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FmodP50608 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FmodP50608 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FmodP50608 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FmodP50608 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FmodP50608 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FmodP50608 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FmodP50608 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FmodP50608 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FmodP50608 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FmodP50608 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FmodP50608 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FmodP50608 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FmodP50608 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FmodP50608 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FmodP50608 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FmodP50608 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FmodP50608 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FmodP50608 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FmodP50608 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FmodP50608 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FmodP50608 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FmodP50608 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FmodP50608 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FmodP50608 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FmodP50608 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FmodP50608 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FmodP50608 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FmodP50608 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FmodP50608 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FmodP50608 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FmodP50608 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FmodP50608 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FmodP50608 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FmodP50608 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FmodP50608 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FmodP50608 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FmodP50608 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FmodP50608 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FmodP50608 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FmodP50608 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FmodP50608 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FmodP50608 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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