Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LtbrP50284 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LtbrP50284 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LtbrP50284 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LtbrP50284 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LtbrP50284 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LtbrP50284 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LtbrP50284 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LtbrP50284 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LtbrP50284 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LtbrP50284 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LtbrP50284 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LtbrP50284 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LtbrP50284 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LtbrP50284 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LtbrP50284 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LtbrP50284 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LtbrP50284 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms