Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms