Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp9P49962 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp9P49962 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp9P49962 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp9P49962 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp9P49962 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Srp9P49962 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp9P49962 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp9P49962 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp9P49962 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp9P49962 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp9P49962 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp9P49962 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp9P49962 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp9P49962 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp9P49962 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp9P49962 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp9P49962 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp9P49962 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp9P49962 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp9P49962 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp9P49962 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp9P49962 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp9P49962 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp9P49962 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp9P49962 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp9P49962 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp9P49962 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp9P49962 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp9P49962 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp9P49962 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp9P49962 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srp9P49962 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms