Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmod1P49813 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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