Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtpreP49446 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtpreP49446 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtpreP49446 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtpreP49446 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PtpreP49446 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtpreP49446 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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