Protein–RNA interactions for Protein: P49312

Hnrnpa1, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hnrnpa1P49312 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hnrnpa1P49312 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hnrnpa1P49312 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms