Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl5P47962 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl5P47962 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms