Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax9P47242 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax9P47242 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax9P47242 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax9P47242 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax9P47242 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax9P47242 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax9P47242 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax9P47242 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax9P47242 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax9P47242 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pax9P47242 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms