Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn1bP46414 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms