Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sept1P42209 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sept1P42209 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sept1P42209 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sept1P42209 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sept1P42209 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sept1P42209 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sept1P42209 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sept1P42209 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sept1P42209 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms