Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp9P41245 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms