Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms