Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col18a1P39061 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms