Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sar1aP36536 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms