Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab17P35292 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab17P35292 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab17P35292 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms