Protein–RNA interactions for Protein: P35175

Stfa1, Stefin-1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa1P35175 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stfa1P35175 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms