Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rom1P32958 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rom1P32958 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rom1P32958 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rom1P32958 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rom1P32958 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rom1P32958 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rom1P32958 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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