Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms