Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Saa4P31532 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Saa4P31532 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Saa4P31532 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Saa4P31532 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Saa4P31532 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Saa4P31532 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Saa4P31532 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Saa4P31532 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Saa4P31532 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Saa4P31532 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Saa4P31532 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Saa4P31532 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Saa4P31532 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Saa4P31532 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Saa4P31532 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Saa4P31532 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Saa4P31532 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Saa4P31532 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Saa4P31532 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Saa4P31532 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Saa4P31532 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Saa4P31532 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Saa4P31532 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Saa4P31532 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms