Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa2P31245 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms