Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccnd3P30282 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccnd3P30282 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccnd3P30282 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccnd3P30282 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccnd3P30282 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccnd3P30282 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccnd3P30282 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccnd3P30282 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccnd3P30282 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccnd3P30282 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccnd3P30282 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccnd3P30282 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccnd3P30282 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccnd3P30282 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccnd3P30282 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccnd3P30282 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccnd3P30282 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccnd3P30282 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccnd3P30282 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccnd3P30282 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccnd3P30282 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccnd3P30282 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccnd3P30282 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccnd3P30282 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccnd3P30282 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccnd3P30282 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccnd3P30282 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccnd3P30282 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccnd3P30282 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccnd3P30282 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccnd3P30282 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccnd3P30282 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccnd3P30282 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccnd3P30282 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccnd3P30282 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccnd3P30282 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms