Protein–RNA interactions for Protein: P29416

Hexa, Beta-hexosaminidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexaP29416 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HexaP29416 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HexaP29416 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HexaP29416 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HexaP29416 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HexaP29416 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HexaP29416 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HexaP29416 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HexaP29416 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HexaP29416 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HexaP29416 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HexaP29416 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HexaP29416 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HexaP29416 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HexaP29416 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HexaP29416 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HexaP29416 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HexaP29416 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HexaP29416 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HexaP29416 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HexaP29416 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HexaP29416 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HexaP29416 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HexaP29416 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HexaP29416 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HexaP29416 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HexaP29416 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HexaP29416 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HexaP29416 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HexaP29416 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HexaP29416 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HexaP29416 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HexaP29416 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HexaP29416 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HexaP29416 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HexaP29416 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HexaP29416 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HexaP29416 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HexaP29416 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HexaP29416 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HexaP29416 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HexaP29416 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HexaP29416 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HexaP29416 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HexaP29416 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HexaP29416 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HexaP29416 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HexaP29416 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HexaP29416 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HexaP29416 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HexaP29416 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HexaP29416 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HexaP29416 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HexaP29416 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HexaP29416 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HexaP29416 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HexaP29416 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HexaP29416 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HexaP29416 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HexaP29416 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HexaP29416 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HexaP29416 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HexaP29416 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HexaP29416 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HexaP29416 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HexaP29416 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HexaP29416 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HexaP29416 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HexaP29416 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HexaP29416 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HexaP29416 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HexaP29416 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HexaP29416 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HexaP29416 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HexaP29416 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HexaP29416 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HexaP29416 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HexaP29416 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HexaP29416 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HexaP29416 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HexaP29416 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HexaP29416 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HexaP29416 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HexaP29416 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HexaP29416 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HexaP29416 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HexaP29416 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HexaP29416 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HexaP29416 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HexaP29416 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HexaP29416 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HexaP29416 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HexaP29416 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HexaP29416 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HexaP29416 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HexaP29416 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HexaP29416 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HexaP29416 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HexaP29416 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HexaP29416 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms