Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms