Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LoxP28301 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LoxP28301 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LoxP28301 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LoxP28301 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LoxP28301 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LoxP28301 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LoxP28301 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LoxP28301 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LoxP28301 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LoxP28301 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LoxP28301 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LoxP28301 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LoxP28301 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LoxP28301 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LoxP28301 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LoxP28301 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LoxP28301 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LoxP28301 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LoxP28301 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LoxP28301 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LoxP28301 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LoxP28301 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LoxP28301 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LoxP28301 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LoxP28301 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LoxP28301 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LoxP28301 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LoxP28301 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LoxP28301 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LoxP28301 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LoxP28301 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LoxP28301 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LoxP28301 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LoxP28301 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LoxP28301 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LoxP28301 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LoxP28301 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LoxP28301 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LoxP28301 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LoxP28301 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LoxP28301 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LoxP28301 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LoxP28301 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LoxP28301 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LoxP28301 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LoxP28301 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LoxP28301 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LoxP28301 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LoxP28301 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LoxP28301 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LoxP28301 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LoxP28301 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LoxP28301 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LoxP28301 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LoxP28301 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LoxP28301 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LoxP28301 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LoxP28301 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LoxP28301 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LoxP28301 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LoxP28301 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LoxP28301 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LoxP28301 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LoxP28301 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LoxP28301 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LoxP28301 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LoxP28301 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LoxP28301 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LoxP28301 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LoxP28301 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LoxP28301 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LoxP28301 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LoxP28301 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LoxP28301 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LoxP28301 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LoxP28301 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LoxP28301 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LoxP28301 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LoxP28301 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LoxP28301 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LoxP28301 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LoxP28301 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LoxP28301 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LoxP28301 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LoxP28301 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LoxP28301 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LoxP28301 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LoxP28301 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LoxP28301 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LoxP28301 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LoxP28301 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LoxP28301 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LoxP28301 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LoxP28301 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LoxP28301 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LoxP28301 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LoxP28301 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LoxP28301 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LoxP28301 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms