Protein–RNA interactions for Protein: P26350

Ptma, Prothymosin alpha, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtmaP26350 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtmaP26350 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtmaP26350 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtmaP26350 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtmaP26350 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtmaP26350 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtmaP26350 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtmaP26350 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtmaP26350 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PtmaP26350 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtmaP26350 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PtmaP26350 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtmaP26350 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtmaP26350 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtmaP26350 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtmaP26350 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtmaP26350 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtmaP26350 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtmaP26350 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtmaP26350 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtmaP26350 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtmaP26350 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtmaP26350 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtmaP26350 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtmaP26350 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtmaP26350 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtmaP26350 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtmaP26350 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms