Protein–RNA interactions for Protein: P25976

Ubtf, Nucleolar transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbtfP25976 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UbtfP25976 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UbtfP25976 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
UbtfP25976 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UbtfP25976 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UbtfP25976 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UbtfP25976 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UbtfP25976 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UbtfP25976 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
UbtfP25976 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UbtfP25976 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UbtfP25976 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UbtfP25976 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UbtfP25976 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UbtfP25976 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
UbtfP25976 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UbtfP25976 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UbtfP25976 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UbtfP25976 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UbtfP25976 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UbtfP25976 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UbtfP25976 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UbtfP25976 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UbtfP25976 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UbtfP25976 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UbtfP25976 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UbtfP25976 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UbtfP25976 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UbtfP25976 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UbtfP25976 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UbtfP25976 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UbtfP25976 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UbtfP25976 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UbtfP25976 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UbtfP25976 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
UbtfP25976 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
UbtfP25976 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
UbtfP25976 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UbtfP25976 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
UbtfP25976 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UbtfP25976 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
UbtfP25976 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UbtfP25976 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UbtfP25976 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms