Protein–RNA interactions for Protein: P25318

Col8a2, Collagen alpha-2(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a2P25318 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col8a2P25318 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col8a2P25318 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col8a2P25318 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col8a2P25318 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col8a2P25318 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col8a2P25318 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms