Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NdnP25233 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NdnP25233 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NdnP25233 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NdnP25233 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NdnP25233 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NdnP25233 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NdnP25233 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NdnP25233 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NdnP25233 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NdnP25233 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NdnP25233 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NdnP25233 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NdnP25233 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NdnP25233 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NdnP25233 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NdnP25233 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NdnP25233 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NdnP25233 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NdnP25233 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NdnP25233 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NdnP25233 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NdnP25233 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NdnP25233 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NdnP25233 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NdnP25233 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NdnP25233 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NdnP25233 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NdnP25233 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NdnP25233 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NdnP25233 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NdnP25233 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NdnP25233 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NdnP25233 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NdnP25233 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NdnP25233 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NdnP25233 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NdnP25233 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NdnP25233 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NdnP25233 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NdnP25233 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NdnP25233 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NdnP25233 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NdnP25233 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NdnP25233 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NdnP25233 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NdnP25233 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NdnP25233 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NdnP25233 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NdnP25233 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NdnP25233 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NdnP25233 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NdnP25233 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NdnP25233 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NdnP25233 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NdnP25233 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NdnP25233 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NdnP25233 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NdnP25233 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NdnP25233 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NdnP25233 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NdnP25233 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NdnP25233 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NdnP25233 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NdnP25233 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NdnP25233 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NdnP25233 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NdnP25233 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NdnP25233 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NdnP25233 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NdnP25233 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NdnP25233 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NdnP25233 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NdnP25233 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NdnP25233 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NdnP25233 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NdnP25233 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NdnP25233 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NdnP25233 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NdnP25233 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NdnP25233 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NdnP25233 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NdnP25233 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NdnP25233 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NdnP25233 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NdnP25233 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NdnP25233 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NdnP25233 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NdnP25233 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NdnP25233 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NdnP25233 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NdnP25233 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NdnP25233 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NdnP25233 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NdnP25233 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NdnP25233 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NdnP25233 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NdnP25233 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NdnP25233 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NdnP25233 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms