Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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Znf239P24399 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf239P24399 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf239P24399 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf239P24399 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf239P24399 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Znf239P24399 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf239P24399 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf239P24399 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Znf239P24399 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Znf239P24399 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf239P24399 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf239P24399 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Znf239P24399 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Znf239P24399 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf239P24399 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf239P24399 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf239P24399 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf239P24399 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf239P24399 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf239P24399 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf239P24399 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Znf239P24399 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Znf239P24399 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Znf239P24399 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Znf239P24399 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf239P24399 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf239P24399 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Znf239P24399 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Znf239P24399 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Znf239P24399 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Znf239P24399 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Znf239P24399 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Znf239P24399 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Znf239P24399 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Znf239P24399 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Znf239P24399 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf239P24399 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf239P24399 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf239P24399 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf239P24399 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf239P24399 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf239P24399 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf239P24399 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf239P24399 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf239P24399 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf239P24399 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf239P24399 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf239P24399 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf239P24399 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf239P24399 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf239P24399 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf239P24399 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf239P24399 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf239P24399 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms